Lezioni

	LEZIONE	ARGOMENTI TRATTATI
1	24-09-2024	Introduzione alle piattaforme di sequenziamento e ai campi di applicazione (genomica, trascrittomica, metagenomica, epigenomica, population genomics: cosa amplifichiamo e quali risultati otteniamo)
2	24-09-2024	Formato fastq e fasta. Campi di applicazione NGS
3	01-10-2024	Controllo di qualità e trimming. Formati dei dati di sequencing: Fasta e fastq
4	01-10-2024	Controllo di qualità e trimming. reads Illumina: Fastqc e trimming
	08-10-2024	Algoritmi di allineamento delle reads contro il genoma
5	08-10-2024	Algoritmi di allineamento contro il trascrittoma
	15-10-2024	Teoria + esercitazione. Controllo qualità e trimming
6	22-10-2024	Teoria+esercitazione. Mapping sul genoma e trascrittoma.
7	29-10-2024	Algoritmi di assembly: OLC, de Bruijn
8	29-10-2024	Algoritmi di assembly: Trinity, rnaSPAdes.
9	05-11-2024	Esercitazioni assembly e annotazione
10	19-11-2024	WGS
11	19-11-2024	RNA-seq
12	26-11-2024	Chip-seq, Rad-seq, metagenomica + Esercitazione
13	26-11-2024	Chip-seq, Rad-seq, metagenomica
	03-12-2024	Dinamica molecolare 1 e 2
14	10-12-2024	Esercitazione Dinamica molecolare
15	12-12-2024	Into to system Biology